Molekulargenetische Diagnostik
Praxis Dr. Mato Nagel

Apolipoprotein L1

Das APOL1-Gen kodiert ein Apolipoprotein, welches an Apolipoprotein A1 bindet und vor allem in HDL-Partikeln vorkommt. Es spielt eine wichtige Rolle beim Metabolismus der Lipide. Genetische Variationen dieses Gens sind mit einer Resistenz gegenüber Trypanosoma brucei Infektionen und einer Neigung zu FSGS Typ 4 assoziiert. After renal transplantation, recipients who carry a risk allele show a poorer kidney allograft outcome, and donors with these alleles are at greater risk of subsequent progressive renal failure. Risk allele carrier more often develop HIV-associated nephopathy when infected and nephritis in lupus erythematodes.

Epidemiologie

Population

Die beiden APOL1-Varianten G1 und G2 sind insbesondere in der Afrikanischen Subsaharapopulation häufig. Hier erreicht die Häufigkeit 1:13-15. Diese Häufigkeit wird mit dem besseren Überleben von Trypanosomen Infektionen erklärt. Interessanterweise ist die Häufigkeit ins Ostafrika, speziell Äthiopien, mit nur 5% deutlich geringer, obwohl auch hier Trypanosoma-Infektionen endemisch sind. Unter Kaukasiern und Asiaten sind diese Genotypen extrem selten.[1]

Erkrankungen

Die Träger der beiden APOL1-Varianten G1 und G2 besitzen ein 5-fach erhöhtes Risiko eine Albuminurie zu entwickeln. Auch der jährliche Abfall der glomerulären Fitrationsrate ist 0,45% schneller.[2]

Außer diesen beiden Risikoallelen G1 und G2 sind bisher keine Mutationen in dem APOL1-Gen beschrieben.

Interpretation

Das G1- (NM_145343.2:[c.1072A>G,c.1200T>G]) und das G2-Allel (NM_145343.2:c.1212_1217delTTATAA) zeigen eine höhere Inzidenz an chronischem Nierenversagen basierend auf einer Neigung zu FSGS. Andererseits sind diese Allele eine protektiver Faktor gegenüber menschlicher Afrikanischer Trypanosomiasis. Träger des Risikoallels weisen ein erhöhtes Risiko für Transplantatversagen nach Nierentransplantation und ein höheres Risiko für die Entwicklung eines Nierenversagens nach Nierenspende auf. Bei HIV-Infektionen kommt es in der Risikopopulation deutlich schneller zu einer HIV-assoziierten Nephropathie. Auch die Nierenbeteiligung bei Lupus erythematodes scheint häufiger zu sein.

Diagnostik:

Clinic Untersuchungsmethoden Familienuntersuchung
Bearbeitungszeit 5
Probentyp genomic DNA
Clinic Untersuchungsmethoden Direkte Sequenzierung der proteinkodierenden Bereiche eines Gens
Bearbeitungszeit 25
Probentyp genomic DNA
Clinic Untersuchungsmethoden Direkte Sequenzierung ausgewählter Gen-Abschnitte
Bearbeitungszeit 20
Probentyp genomic DNA
Clinic Untersuchungsmethoden Hochdurchsatz-Sequenzierung
Bearbeitungszeit 25
Probentyp genomic DNA

Krankheiten:

Resistenz gegenüber Trypanosoma brucei
APOL1
Hereditäre FSGS vom Typ 4
APOL1
Apolipoprotein-Mangel
APOA5
APOB
APOC1
APOC2
APOC3
APOE
APOL1
APOM
Apolipoprotein A1-Mangel
APOA1
Apolipoprotein A2-Mangel
APOA2
Apolipoprotein F-Mangel
APOF
Apolipoprotein H-Mangel
APOH
CLU

Referenzen:

1.

Duchateau PN et al. (2001) Apolipoprotein L gene family: tissue-specific expression, splicing, promoter regions; discovery of a new gene.

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2.

Page NM et al. (2001) The human apolipoprotein L gene cluster: identification, classification, and sites of distribution.

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Mimmack ML et al. (2002) Gene expression analysis in schizophrenia: reproducible up-regulation of several members of the apolipoprotein L family located in a high-susceptibility locus for schizophrenia on chromosome 22.

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4.

Monajemi H et al. (2002) The apolipoprotein L gene cluster has emerged recently in evolution and is expressed in human vascular tissue.

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5.

Vanhamme L et al. (2003) Apolipoprotein L-I is the trypanosome lytic factor of human serum.

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6.

Pérez-Morga D et al. (2005) Apolipoprotein L-I promotes trypanosome lysis by forming pores in lysosomal membranes.

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7.

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8.

Ko WY et al. (2013) Identifying Darwinian Selection Acting on Different Human APOL1 Variants among Diverse African Populations.

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9.

Duchateau PN et al. (1997) Apolipoprotein L, a new human high density lipoprotein apolipoprotein expressed by the pancreas. Identification, cloning, characterization, and plasma distribution of apolipoprotein L.

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Sampson MG et. al. (2016) Integrative Genomics Identifies Novel Associations with APOL1 Risk Genotypes in Black NEPTUNE Subjects.

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Chen TK et. al. (2016) The evolving science of apolipoprotein-L1 and kidney disease.

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Tzur S et. al. (2010) Missense mutations in the APOL1 gene are highly associated with end stage kidney disease risk previously attributed to the MYH9 gene.

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